İstanbul Üniversitesi’nin (İÜ) Çapa ve Cerrahpaşa kampüslerini yenilemek için 2011 yılında başladığı çalışmalarda aradan geçen 6 yıla karşın çivi dahi çakılamadı. İlk adım 2011 yılında İtalyan Proger firması ile master planı ve ön proje anlaşması imzalanması ile atıldı. 9 Ocak 2014 tarihinde de tartışmalara neden olan TOKİ-İÜ protokolü imzalandı. Protokol kapsamında İÜ, Küçükçekmece Gölü çevresindeki toplam 3 bin 685 dönüm arazisini TOKİ’ye devretti. Protokolün diğer tarafı olan TOKİ bu tartışmalı araziler karşılığında İÜ’nün Çapa ve Cerrahpaşa’daki eğitim-öğretim ve hizmet binalarını yerinde yenileyecek, Avcılar’daki kampüste sosyal tesisler inşa edecekti. Araziler birkaç ay içinde TOKİ’ye devredildi ancak TOKİ bugüne dek fakülte binalarını yenilemek için adım atmadı. Protokol, İÜ Rektörü Prof. Dr. Yunus Söylet döneminde imzalanmıştı. Söylet o dönemde protokol ile ilgili şu açıklamayı yapmıştı: “Bu konuda devlet kurumlarımızla çok sayıda görüşme yaptık. Onlar da yerinde yeniden yapılanma konusunda ikna oldular. Yenileme çalışmaları için koruma kurullarına gerekli müracaatlar yapıldı.” Türk Tabipleri Birliği Başkanı ve İÜ İstanbul Tıp Fakültesi Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Bölümü Öğretim Üyesi Prof. Dr. Raşit Tükel, TOKİ ile yapılan protokolün akıbetinin belirsiz olduğunu ifade ederek şöyle konuştu: “Cumhurbaşkanı’nın açıklaması ile taşınma tartışması gündeme geldi. Bunun için yeni bir protokol, sözleşme gerek. TOKİ ile protokol hâlâ geçerli mi, iptal edildi mi bilmiyoruz. Bu süreç donduruldu ya da kapalı kapılar ardında başka kararlar alındı.”