Duruşmada esas hakkında savunma yapan Eliaçık, "Ben Yenibosna'daki Din Alimleri Derneği'ndeki seminerde kastettiğim Diyarbakır, Cizre gibi yerlerde kazılan hendekleri meşru gösterme değildir. İnternette yaptığım söyleşide devletin terörle mücadelede niçin yanlış yaptığını dile getirmek istedim. Özellikle hak ihlallerini dile getirmek istedim. Ben bunları sert bir dille eleştirdim. Hatta ahlaksızca iğrenç savaşlardır. Ben özellikle yapılan bu eylemlerin Cenvre Sözleşmesi'ne ve TCK'ya ve İslam ahlakına aykırı olduğunu düşünüyorum. Bana göre bu eylemlerin cezalandırılması gerekiyor. Sosyal medya hesaplarımdan da özellikle hak ihlallerini eleştirdim. Yapmış olduğum eleştiriler düşünce ve fikir özgürlüğü kapsamında değerlendirilmelidir. Eleştirilerde kamu yararı vardır. Beraatımı istiyorum" dedi.

Mahkeme heyeti kararında, Eliaçık'ın, PKK terör örgütünün eylemlerini övdüğü ve meşrulaştırdığını belirtti.

Mahkeme, Eliaçık'ın "Silahlı terör örgütü propagandası yapmak" suçundan 6 yıl 3 ay hapis cezasına çarptırılmasına hükmetti. Mahkeme heyeti ayrıca hüküm kesinleşene kadar Eliaçık’ın, yurtdışına çıkışının yasaklanmasına, İstanbul il sınırlarını terk etmemesine ve haftada iki gün karakola giderek imza atmasına karar verdi.